注意：FlowLayoutPanelコントロールは.NET Framework 2.0以降でのみ使用できます。
FlowLayoutPanelに配置されるコントロールの順番は、FlowLayoutPanel.Controlsコレクションの順番で決まるようです。よって、コントロールの順番を変更するには、変更するコントロールのインデックスを変更すればよいということになります。そのためには、Control.ControlCollection.SetChildIndexメソッドが便利です。
「FlowLayoutPanelコントロールを使って、コントロールを縦や横に整列させる」で紹介したサンプル「FlowLayoutPanel2.exe」で、コントロールを先頭に移動する例を紹介しています。以下にその抜粋を示します。currentButtonというコントロールを移動させています。
flowLayoutPanel1.SuspendLayout()
'currentButtonのインデックス値を0にして先頭にする
flowLayoutPanel1.Controls.SetChildIndex(currentButton, 0)
flowLayoutPanel1.ResumeLayout()
flowLayoutPanel1.SuspendLayout();
//currentButtonのインデックス値を0にして先頭にする
flowLayoutPanel1.Controls.SetChildIndex(currentButton, 0);
flowLayoutPanel1.ResumeLayout();
（この記事は、「.NETプログラミング研究」で紹介したものを基にしています。）
注意：この記事では、基本的な事柄の説明が省略されているかもしれません。初心者の方は、特に以下の点にご注意ください。